22.2.2005, 15:09 Uhr
Neue Spezies aus alten Daten
Wenn Forscher die DNA eines Organismus sequenzieren, erfassen sie mitunter mehr als eine Spezies. Entsprechende Resultate präsentieren amerikanische Forscher im Fachblatt "Genome Biology". In den Rohdaten dreier Fliegengenome stießen sie auf DNA-Sequenzen bislang unbekannter Parasiten.
Steven Salzberg vom Institute of Genomic Research in Rockville, Maryland, und seine Kollegen analysierten Daten aus dem Trace Archive, einer öffentlich zugänglichen Datenbank für bei Sequenzierungsprojekten angefallene Rohdaten. "Ganz besonders dann, wenn das Erbgut [...] von einer Art stammt, die von anderen Organismen besiedelt wird, könnte ein Projekt beträchtlicher Mengen genomischer DNA des Symbionten bzw. Parasiten liefern", so die Überlegung der Forscher.
Um ihre Vermutung zu testen, fahndeten sie in den unbearbeiteten Genomdaten von sieben Fliegenarten nach Hinweisen auf das Bakterium Wolbachia - und wurden gleich dreimal fündig: Die Drosophila-Arten D. ananassae, D. simulans und D. mojavensis werden demnach von bislang unbekannten Vertretern der Art Wolbachia pipientis besiedelt. Bis zu 95 Prozent der Bakteriengenome und Hunderte neuer Gene ließen sich aus den Rohdaten rekonstruieren, berichten Salzberg und Kollegen.
Bakterien der Gattung Wolbachia leben in den Zellen ihrer Wirte - Insekten und andere Wirbellose - und verhalten sich dort höchst unterschiedlich. Für einige Wirte sind sie harmlose Mitbewohner, bei anderen manipulieren sie deren Fortpflanzung zwecks Optimierung der eigenen Ausbreitung. Nach Ansicht der Forscher können die neuen Daten helfen, die Evolution Wolbachias und seiner unterschiedlichen Strategien aufzuklären. "Die Entdeckung dieser drei neuen Genome belegt, von welch immensem Nutzen die Veröffentlichung unbearbeiteter Sequenzdaten sein kann", schließen sie.
Forschung: Steven L. Sazberg und William C. Nelson, The Institute for Genomic Research, Rockville, Maryland; und andere
Online-Veröffentlichung Genome Biology, 2005, 6:R23, DOI 10.1186/gb-2005-6-3-r23
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Der Artikel online
Wolbachia
Trace Archive
The Institute of Genomic Research
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